Сергей Евгеньевич Стефаненко родился 3 августа 1977 года в Могилевском районе. В 2005 году окончил Академию Министерства внутренних дел Республики Беларусь. Службу начинал в должности инспектора группы дознания отдела внутренних дел администрации Ленинского района города Бобруйска. затем проходил службу в этом же отделе на различных должностях. В дальнейшем переведен в УВД Бобруйского горисполкома, где возглавил отдел дознания предварительного расследования.
В Следственном комитете – с момента его основания. Прошел путь от следователя по ОВД следственной группы Бобруйского городского отдела Следственного комитета до начальника Кировского районного отдела Следственного комитета.
Среди государственных наград – медали «За безупречную службу» III и II степеней.